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全長16S / 18S二代測序
?產品介紹
基于二代測序技術手段，進行基因組組裝和基本分析，獲得高質量基因組序列。為該物種的后基因組學研究奠定基礎。
簡單基因組：
CONTIG N50≥200KB，復雜基因組（小于2G）：contig N50≥100Kb。
簡單基因組6個月，復雜基因組視根據具體情況而定。
?分析內容
標準信息分析
①下機數據過濾；
②基因組組裝；
③全基因組精細注釋：編碼基因預測；
重復序列注釋和轉座元件分類；Non-coding RNA注釋；假基因注釋；
④基因功能注釋：Nr庫注釋；KEGG代謝通路注釋；
COG注釋（Gene Ontology）；TrEMBL注釋；調控Motif預測。
?高級信息分析
①基因家族聚類，特有、共有基因和基因家族統計；
②基因家族擴張收縮分析；
③系統發育樹的構建；
④物種分化時間推算（需要化石標定）；
⑤LTR形成時間估算；
⑥全基因組復制事件（一般為植物基因組的分析項）；
⑦選擇壓力分析。
